Dækket på 110 kort består af produktionsbygninger (indigo, sukker, tobak, kaffe og sølv) og "violette" bygninger, der giver særlige kræfter eller ekstra sejrpoint. Kort fra hånden kan enten bygges eller bruges som penge til at bygge noget andet; kort fra bunken bruges til at repræsentere varer, der er produceret af produktionsbygningerne, i hvilket tilfælde de sidder nedad. En syv-korts håndgrænse håndhæves en gang pr. Runde.
I hver runde (eller regeringsførelse) vælger hver spiller på sin side en af de tilgængelige roller og udløser en begivenhed, der normalt påvirker alle spillere, såsom at fremstille varer eller opføre bygninger. Den person, der vælger rollen, får et privilegium, såsom at producere flere varer eller bygge billigere.
Selvom det ligner konceptet som Puerto Rico, har spillet mange forskellige mekanismer. Spillet inkluderer især ingen kolonister og ingen forsendelse af varer; vareproduktion og handel er normalt begrænset til et kort pr. fase; og handler kan ikke blokeres. Sejrpoint opnås udelukkende ved at bygge, og spillet slutter, så snart en spiller har opstillet tolv bygninger.
Denne anden udgave af San Juan inkluderer alle kortene fra det originale spil såvel som de ekstra bygningskort fra alea Treasure Chestbut ikke begivenhedskortene fra den udvidelse. Denne udgave indeholder også et nyt bygningskort, der ikke tidligere var tilgængeligt: "The Hut", en bygning, der giver et kort, når intet sælges i den erhvervsdrivende fase.
Anden version.